Mungkin saat minum habbatussauda biasanya akan timbul gejala penyembuhan yang menyebabkan tubuh merasa tidak nyaman. Gejala-gejala penyembuhan yang dirasakan merupakan proses pembuangan racun-racun (detoksifikasi) yang ada di dalam tubuh yang memunculkan keadaan berbeda pada tiap orang.
Jika pada wanita sebagian kecil ada yang mengalam keputihan, wajah berjerawat, gatal-gatal pada penderita asma (atau penyakit alergi lainnya), pegal-pegal pada pinggang, kaki dan tangan. Sedangkan gejala umum lainnya seperti perut mual atau kembung, batuk berdahak dengan mengeluarkan banyak lendir, gangguan emosional, dan lainnya. Namun gejala-gejala tersebut dirasakan berbeda pada setiap orang.